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岷县黑裘皮羊MSTN基因序列测序与多态性分析

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为进一步探究岷县黑裘皮羊的MSTN基因序列预测及多态性,采用5对引物对岷县黑裘皮羊MSTN基因进行PCR扩增,利用生物信息学方法对岷县黑裘皮羊MSTN基因的结构、理化性质、编码蛋白信号肽、高级结构预测等进行分析,并讨论了岷县黑裘皮羊与其他物种MSTN氨基酸序列的进化关系。研究结果表明,岷县黑裘皮羊MSTN基因PCR扩增全长为7.3kb,MSTN蛋白空间结构符合TGF-超家族的基本特征,并符合已知MSTN蛋白的一般结构特征,与猪、灵长类及反刍类动物的分子进化距离较近。
 
关键词:岷县黑裘皮羊;MSTN;基因序列;多态性;更多范文
岷县黑裘皮羊MSTN基因序列测序与多态性分析
岷县黑裘皮羊是我国古老的绵羊种群,属山谷型藏羊,是我国养羊业中珍贵的地方品种[1]。岷县黑裘皮羊以生产黑色二毛裘皮著称,主要分布在甘肃省[2]。虽然该品种是我国独特的可产二毛裘皮的原始地方品种,但对该品种的研究却较少[3]。目前,岷县黑裘皮羊群体数约为4000只,纯种数量仅700~800只,已经濒危[4]。作为重要的遗传资源,对其进行遗传学相关研究对于保护岷县黑裘皮羊的种群,实现对该种群进一步的开发利用具有重要意义。
MSTN全称肌肉生长抑制素(Myostatin),又称GDF-8(growth differentiation factor 8),属于TGF-(transforming growth factor转化生长因子超家族,作为骨骼肌分化负调控因子,MSTN具有抑制肌细胞分化、生长的作用[5]
本文对岷县黑裘皮羊MSTN基因序列测序与多态性进行分析,采用长期自然放牧条件下的岷县黑裘皮羊,克隆其MSTN基因并进行全序列测定;与其他物种间进行序列比对,推测该基因编码蛋白质的二级结构和理化性质;同时利用PCR-SSCP技术分析了岷县黑裘皮羊MSTN基因部分序列的多态性。本研究旨在改善地方优良品种、利用MSTN基因开展岷县黑裘皮羊分子育种技术研究提供理论基础,为建立岷县黑裘皮羊基因文库提供可靠的信息。
试验采用典型群随机抽样法,采用自然放牧条件下岷县黑裘皮羊,取10只作为对象。采样岷县黑裘皮羊均来自中心产区,采样个体具有该品种的明显特征。用5ml的加有枸橼酸钠抗凝剂的血液采集管从其颈静脉采集血样,立即放入液氮中,带回实验室,-80℃保存。
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